Jumat, 21 Desember 2012

Tugas rekayasa genetika;Rapamycin Induces The Anti-Apoptotic Protein Survivin In Neuroblastoma

Rapamycin Induces The Anti-Apoptotic Protein Survivin In Neuroblastoma
(Induksi apoptosis survivin anti-protein dalam neuroblastoma oleh Rapamycin)

Ayman Samkari, Zachary A Cooper, Michael P Holloway, Jiebin Liu, Rachel A Altura
Departemen Ilmu Kesehatan Anak, Divisi Hematologi-Onkologi, The Warren Alpert Medical School of Brown University dan Rhode Island Hospital, 593 Eddy Street, Providence, RI, 02903,USA
Received January 6, 2012; accepted January 25, 2012; Epub February 10, 2012; Published March 30, 2012
                
Pengantar
          Neuroblastoma adalah tumor padat paling umum masa bayi dan yang paling umum kedua ekstraksi- ranial tumor ganas dari masa kanak-kanak . Terhitung untuk 8-10% dari semua kanker terjadi pada anak dan sekitar 15% dari semua kematian akibat kanker pada anak- anak . Neuroblastoma muncul dari progenitor sel-sel sistem saraf simpatik. Presentasi klinis biasanya tergantung pada tumor lokasi, luasnya penyakit, dan kehadiran atau
adanya gejala paraneoplastic. Kriteria untuk pementasan neuroblastoma adalah berdasarkan Neuroblastoma Internasional Stag- ing System (INSS) . Banyak klinis dan faktor biologis  telah ditunjukkan untuk memprediksi perilaku klinis neuroblastoma termasuk: usia presentasi, stadium tumor, histopatologi tumor atau Shimada klasifikasi (menguntungkan vs unfavor- mampu), indeks DNA (ploidi), MYCN gen amplifica-
tion dan hilangnya kromosom 1p . Meskipun perbaikan signifikan telah dilakukan dalam kemoterapi, operasi, immunother- APY dan transplantasi sel induk, beberapa berisiko tinggi pasien masih memiliki tingkat kelangsungan hidup miskin kurang
dari 40%.
             Jalur sinyal kematian sel tumor memiliki peran penting dalam pengembangan dan keseimbangan tumor neuroblastoma. Disregulasi apoptosis telah ditemukan adanya  tumorigenesis serta chemother- resistensi APY. Apoptosis diatur oleh keseimbangan antara proapoptotic dan faktor antiapoptotik. Salah satu kelas protein anti-apoptosis dikenal sebagai inhibitor dari apoptosis proteins (IAP) survivin yang terkecil. Survivin umumnya berupa pediatric neuroblastoma tumor dan hadir dalam sebuah wilayah keuntungan 17q25 dalam banyak tumor . Tingginya kadar ekspresi terkait dengan stadium lanjut, diploidy, dan MYCN amplifikasi, menunjukkan bahwa peningkatan survivin ex- pression berkorelasi dengan indikator prognostic penyakit ini . Salah satu fitur kunci dari survivin adalah jumlah besar
dari jalur molekuler yang terlibat dalam keduanya. Dengan demikian, survivin muncul sebagai regulator sentral dalam beberapa jaringan molekuler, dari mana sinyal paralel jalur cabang untuk mengatur seluler lainnya jalur. Salah satu jalur paralel seperti di- volves target mamalia dari rapamycin(MTOR) protein. mTOR telah terbukti memainkan peran penting
dalam proliferasi seluler dan sintesis protein dan sering diubah pada kanker manusia,
termasuk neuroblastoma. mTOR bentuk dua yang berbeda kompleks melalui unik acces- protein sory: (i) peraturan terkait protein mTOR (RAPTOR) dan (ii) rapamycin-insensitive pendamping mTOR (RICTOR), mengakibatkan mTORC1 dan mTORC2 kompleks, masing-masing, yang keduanya terlibat dalam tumorigenesis. mTORC1 mengatur inisiasi mRNA terjemahan dan dengan demikian mengendalikan tingkat protein sintesis protein melalui hilir hu- man p70 S6 kinase (pS6K) dan eIF4E [12]. Acti- elevasi dari mTORC1 menginduksi tumorigenesis oleh menekan autophagy dan upregulating nu-
merous gen, seperti HIF1α, yang meningkatkan angiogenesis [14]. mTORC2 diregulasi dalam beberapa subtipe kanker, termasuk otak GLIO- mas dan kanker payudara. mTOR inhibitor- tor yang digunakan dalam uji klinis untuk leukemia , paru-paru dan kanker payudara . Mereka adalah juga di Tahap 1 percobaan untuk refraktori atau berulang
tumor padat pediatrik [20] yang meliputi neuro- blastoma karena bukti baru yang
PI3K/AKT/mTOR aktivasi jalur sinyal adalah acara umum dalam penyakit ini [21, 22]. Itu
kemanjuran mTOR menghambat dalam pengobatan berbagai jenis kanker masih sedang dievaluasi. Penelitian sebelumnya meneliti peran rapamycin dalam apoptosis dan mengevaluasi efek dari ra- pamycin pada survivin protein anti-apoptosis pada
berbagai jenis kanker, menunjukkan bahwa dalam- duces penangkapan siklus sel selama fase G1 dan menyebabkan penurunan ekspresi survivin [23]. Tidak ada studi sampai saat ini yang telah meneliti efek inhibitor mTOR pada jalur survivin di neuroblastoma.
           Berbeda dengan studi tersebut menunjukkan suatu penurunan ekspresi survivin dalam menanggapi rapamycin [24-26], di sini kita menunjukkan bahwa rapamycin menginduksi tumor neuroblastoma di survivin sel dengan mekanisme molekuler yang meliputi stabilisasi mRNA survivin, dan bahwa rapamy-sel-sel neuroblastoma cin-diobati relatifterlindung dari efek kematian sel diamatidi lain jenis sel tumor. Data ini menunjukkanrapamycin yang harus hati-hati dipertimbangkansebagai terapi potensial untuk penyakit ini karena mungkinakan mendorong bukan menghambat tumor beberapasurvival jalur.
Diskusi  
          Neuroblastoma adalah tumor embrional dari otonom sistem saraf, dengan kejadian
10,2 kasus per juta anak di bawah usia 15 tahun. Meskipun kemajuan besar dalam diagnosis dan pengobatan, peningkatan angka kesembuhan terutama diamati di antara pasien dengan low-risiko penyakit, pasien berisiko tinggi telah menunjukkan perbaikan sederhana dalam hasil 10 tahun terakhi. Terapi saat ini meliputi kemoterapi dan radiasi yang intensif diikuti oleh transplantasi sumsum tulang autologous, 13 - cis-retinoic acid, dan anti-gd2 immunother- APY. Salah satu tantangan utama dalam risiko neuroblastoma tinggi adalah untuk menemukan target yang efektif terapi yang berpotensi meningkatkanhasil yang masih belum valid. 
            Salah satu kelas yang muncul dari obat yang memiliki berada di bawah pertimbangan untuk Terapi neuroblastoma adalah inhibitor mTOR, berdasarkan penelitian sebelumnya yang menunjukkan bahwa phospho-mTOR, dan yang hilir protein, phospho-p70S6K dan
phospho-4EBP1 yang sangat disajikan dalam penyakit. Meskipun ada data yang bertentangan ,apakah inhibitor mTOR downregulate MYCN ekspresi protein [22, 39], mTOR inhibitor- tor telah ditunjukkan dalam beberapa studi in vitro untuk menginduksi apoptosis dan menghambat proliferasi sel neuroblastoma. Karena kebanyakan pasien berisiko tinggi neuroblastoma awalnya menanggapi terapi, termasuk konvensi- agen kemoterapi internasional, namun pada akhirnya kambuh, ada kemungkinan bahwa tumor ini memiliki tinggi tingkat resistensi obat yang diperoleh. Mekanisme molekuler resistensi obat di sel tumor neuroblastoma yang masih dalam inves- tigation. Satu hipotesis yang disarankan oleh data kami adalah bahwa peningkatan tingkat ekspresi survivin, berpotensi disebabkan oleh kemoterapi agen, pada akhirnya dapat berkontribusi terhadap obat- resistensi dalam tumor.

Peningkatan survivin
            Ekspresi telah terbukti meningkatkan che- motherapy perlawanan di lain jenis sel tumor termasuk kanker payudara, kanker tiroid, non-sel kecil kanker paru-paru, prostat Kanker, dan chondrosarcoma. Studi lain juga menunjukkan bahwa survivin dapat menginduksi radiasi-resistance pada kanker kolorektal dan dalam glioblastoma. Kami menemukan bahwa rapa- Mycin meningkatkan kadar survivin di sel neuroblastoma, tetapi tidak pada sel kanker paru-paru menunjukkan rapamycin yang mungkin memainkan peran dalam meningkatkan kemoterapi dan terapi radiasi—ketahanan di neuroblastoma. Studi in vitro di masa depan menggunakan obat ini dalam kombinasi dengan lainnya che- agen motherapeutic dan / atau radiasi di sel neuroblastoma dalam model xenograft
akan membantu untuk mengkonfirmasi hipotesis ini.
    Hasil kami menyediakan mekanisme potensial dengan yang rapamycin meningkatkan tingkat survivin oleh meningkatkan kondisi mapan tingkat mRNA dan en- hancing mengikat HSP90. HSP90 adalah con-a menjabat molekul pendamping yang berpartisipasi dalam menstabilkan dan mengaktifkan beberapa protein pada faktor cluding transkripsi, protein kinase, dan co-pendamping dan merupakan fasilitator kanker kelangsungan hidup sel . Dalam sel HeLa, penghambatan dari HSP90 protein survivin ditingkatkan oleh degradasi, yang mengarah ke penangkapan siklus sel dan kematian sel. Saat ini, terdapat bukti yang kuat mengenai manfaat dari HSP90-hambatan dalam neuroblastoma, karena dapat meningkatkan ekspresi p53 dan mendestabilkan MYCN ekspresi gen dalam tumor. Mengingat pengamatan kami bahwa rapamycin dapat meningkatkan kadar protein survivin dalam neuroblastoma dengan meningkatkan HSP90-survivin mengikat, pilihan terapi yang potensial mungkin untuk gabungan penggunaan inhibitor mTOR dengan HSP90 inhibitor, dalam rangka untuk mendapatkan manfaat penuh dari mTOR inhibitor tanpa mendorong survivin ex-pression, dan kemudian mempromosikan kemoTerapi resistensi.

Kesimpulan
      Rapamycin menginduksi survivin ex- pression di MYCN-sel neuroblastoma diperkuat baris yang dapat berkontribusi pada hilangnya rapa-
Mycin-induced dari efek kematian sel dari obat ini dalam sel-sel ini. Selanjutnya induksi survivin di tumor ini menunjukkan rapamycin yang tidak mungkin efektif dan berpotensi meningkatkan chemotherapy-perlawanan. Ketika mempertimbangkan mTOR inhibitor untuk pengobatan neuroblastoma, Kombinasi terapi dengan inhibitor HSP90 dapat meningkatkan efek menguntungkan utuk mereka dan mengurangi potensi efek samping.


Selasa, 18 Desember 2012

Biokon Nusakambangan

-->
CAGAR ALAM NUSAKAMBANGAN
Mata kuliah : Biologi Konservasi
UNIVERSITAS DIPONEGORO
(Kelompok 9 : Edi Purnomo 24020110120040, Tias Susiana 24020110130043, Ermita Br Tarigan 24020110130044, Ruri T. Ulfa 24020110130045, Tsanya D. Falasifa 24020110130046)
1.     Sejarah
Secara tradisional, penerus dinasti Kesultanan Mataram sering melakukan ritual di pulau ini dan menjadikannya sebagai “hutan ritual”. Di bagian barat pulau, di sebuah gua yang terletak di areal hutan bakau, ada semacam prasasti peninggalan zaman VOC. Di ujung timur, di atas bukit karang, berdiri mercu suar Cimiring dan benteng kecil peninggalan Portugis. Berbagai macam tumbuhan khas ritual budaya Jawa ditanam di sini. Nusa Kambangan tercatat sebagai pertahanan terakhir dari tumbuhan wijayakusuma yang sejati. Dari sinilah nama pulau ini berasal: Nusa Kembangan, yang berarti “pulau bunga-bungaan”.

2.     Wilayah Nusakambangan
Wilayah Cagar Alam Nusakambangan terbagi dalam beberapa wilayah. Meliputi Cagar Alam Nusakambangan Timur seluas 277 hektare, Cagar Alam Nusakambangan Barat seluas 928 hektare, Wijaya Kusuma 1 hektare, dan Karangbolong 0,5 hektare.
            Kemewahan kawasan Nusakambangan :
·         Flora di kawasan ini mencakup hutan mangrove (mangrove forest) di Segara Anakan dan hutan tropika (tropical rain florest) di Pulau Nusakambangan.
·         Hutan di Pulau Nusakambangan merupakan hutan alam tropika basah daratan rendah
·         Memiliki keanekaragaman flora yang cukup tinggi
·         Jenis pelalar atau kruing pantai merupakan jenis tanaman endemik yang harus dilindungi karena hanya tumbuh di daerah nusakambangan dan tidak dijumpai di negara manapun di dunia. 
·         Memiliki beberapa jenis satwa dan beberapa diantaranya cukup langka.
·         Memiliki beberapa jenis burung atau aves
·         Memiliki  beberapa spesies ikan karang yang berasosiasi terhadap ekosistem terumbu karang.
·         Kaya akan terumbu karang.

3.     Permasalahan dan Solusi
Permasalahan
·         Terus menjadi sasaran para penjarah.  Hewan hasil buruan kemungkinan besar akan diawetkan dan diperjual belikan dalam bentuk hiasanan.
·         Kualitas alam Pulau Nusakambangan, Cilacap, yang selama ini menjadi penopang kebutuhan air bersih bagi masyarakat Kampung Laut maupun pelindung pesisir selatan Jawa, dirasakan semakin menurun.
·         Eksplorasi batu gamping/kapur yang dijalankan PT Holcim pada kawasan hutan Nusakambangan.
·         Penebangan liar yang dilakukan oleh masyarakat luar Cilacap. Total luas kerusakan hutan itu diperkirakan mencapai 5.000 hektare. Kesulitan untuk menghijaukannya kembali salah satu penyebabnya adalah sulitnya mengakses Pulau Nusakambangan karena harus melalui izin Departemen Hukum dan HAM.
·         Keadaan flora di hutan-hutan ini di beberapa tempat terutama di bagian barat telah mulai mengalami kerusakan.
·         Pengeboman ikan oleh nelayan sekitar juga penggunaan bahan kimia (potasium sianida).
·         Pencurian kayu dan penebangan liar oleh masyarakat luar pulau yang mengganggu kelestarian hutan.
·         Adanya akses masuk perburuan liar lewat jalur pertanian.
Solusi
·         Pemburu yang ditangkap akan diproses secara hukum. Langkah ini sebagai bagian dari upaya untuk menjaga dan tetap melestarikan Cagar Alam Nusakambangan Barat dari upaya penjarahan.
·         Untuk menyelamatkan Nusakambangan tak hanya tanggung jawab salah satu pihak, melainkan juga seluruh pihak yang memiliki kepentingan dengan Nusakambangan. Kepala LP di Nusakambangan juga punya tanggung jawab untuk ikut melakukan penghijauan.
·         Diperlukan suatu usaha pelestarian alam yang memadai di kawasan hutan ini.
·         Perlu dilakukan pengelolaan secara terpadu dan pengawasan terhadap kegiatan-kegiatan ilegal di pulau ini agar kelestarian alamnya terpelihara.
·         Pelestarian penyu juga dapat dilakukan di pulau ini, yang merupakan salah satu upaya untuk melestarikan sumberdaya perikanan ini dari kepunahan,
Sumber :
Madina Nusrat (www.kompas.com)
http://www.vhrmedia.com/2010/detail.php?.e=6183


Senin, 10 Desember 2012

Senyawa pulutan Heptachlor

SENYAWA POLUTAN HEPTACHLOR


Makalah ini disusun untuk menyelesaikan tugas dari mata kuliah pencemaran lingkungan

Disusun oleh :
Edi Purnomo                         (24020110120040)
Eka Fitriani                           (24020110120002)
Wisnu Adi W                        (24020110130057)
Ibni Jeudi J                            (24020110130050)


JURUSAN BIOLOGI
FAKULTAS SAINS DAN MATEMATIKA
UNIVERSITAS DIPONEGORO
SEMARANG
2012



HEPTACHLOR
http://htmlimg4.scribdassets.com/2sh42cqqps1nk0tm/images/17-b9fff70397.png
Heptaklor merupakan senyawa organoklorin yang digunakan sebagai insektisida. Biasanya dijual dalam bentuk bubuk putih atau cokelat. Heptachlor adalah salah satu insektisida siklodiena. Pada tahun 1962, Silent Spring Rachel Carson mempertanyakan keamanan heptaklor dan insektisida terklorinasi lainnya. Karena strukturnya sangat stabil,heptaklor dapat bertahan di lingkungan selama beberapa dekade. EPA AS telah membatasi penjualan produk heptaklor dengan aplikasi spesifik pengendalian kebakaran pada transformator semut bawah tanah. Jumlah yang dapat hadir dalam makanan yang berbeda diatur (Hidayat, 2001). Heptaklor analog dengan sintesis siklodiena lainnya dimana heptaklor diproduksi melalui reaksi Diels-Alder dari heksaklorosiklopentadiena dan siklopentadiena. Dibandingkan dengan klordan, heptaklor memiliki sifat sekitar 3 - 5 kali lebih aktif sebagai insektisida, tetapi lebih inert secara kimia sehingga lebih tahan terhadap alkali yang air dan kaustik. Heptaklor merupakan polutan organik yang persisten (POP). Ia memiliki waktu paruh + 1,3-4,2 hari di udara, + 0,03-0,11 tahun di air dan + 0,11-0,34 tahun di tanah. Seperti POPs lainnya, heptaklor bersifat lipofilik dan kurang larut dalam air (0,056 mg/L pada suhu25° C), sehingga cenderung terakumulasi dalam lemak tubuh manusia dan hewan (Hidayat,2001).
Kegunaan utamanya adalah untuk menangani serangga di tanah, rayap, serangga di tanaman kapas, belalang, dan beberapa hama tanaman lainnya. Kelarutan heptaklor dalam air sangat rendah, sedangkan kelarutannya di dalam lemak tinggi. Kemampuan heptaklor untuk menguap cukup tinggi dan dapat menjadi bagian dari atmosfer saat terjadi penguapan (Ritter, 1997). Persistensi heptaklor di tanah terbilang tinggi karena memiliki kecenderungan untuk teradsorbsi di dalam tanah serta sangat sulit mengalami pergerakan menuju air tanah. Faktor lainnya yang mempengaruhi persistensi heptaklor adalah temperatur dan kelembaban.  Dikarenakan kelarutannya yang rendah dalam air dan kemampuan menguapnya yang tinggi dari air, maka konsentrasi heptaklor yang ditemukan di sampel air relatif rendah, yaitu berkisar antara 0,133-1,67 ppb.
Dosis tinggi heptaklorbila terkena hewan yang baru lahir menyebabkan penurunan berat badan dan kematian (Miller, 2002). Batas adanya kandungan heptaklor menurut EPA untuk air minum adalah 0,0004mg/L dan 0,0002 mg/L untuk epoksida heptaklor. Batas heptaklor menurut FDA padatanaman pangan adalah 0,01 ppm, dalam susu adalah 0,1 ppm, dan pada makanan laut adalah0,3 ppm.
PENANGANAN
1.      Pengolahan Primer (Primary Treatment)
Proses pengolahan secara fisika. Urutannya yaitu penyaringan, pengendapan, dan pengapungan.
2.      Pengolahan Sekunder (Secondary Treatment)
Proses pengolahan secara biologis, yaitu dengan melibatkan mikroorganismeyang dapat mengurai/mendegradasi bahan organik. Mikroorganisme yang digunakan umumnya adalah bakteri aerob.
a.         Metode trickling filter
Pada metode ini, bakteri aerob yang digunakan untuk mendegradasi bahan organik melekat dan tumbuh pada suatu lapisan media kasar, biasanya berupa serpihan batu atau plastik, dengan ketebalan ± 1 -3 m.
b.         Metode activated sludge
Pada metode activated sludge atau lumpur aktif, limbah cair disalurkan ke sebuah tangki dan di dalamnya limbah dicampur dengan lumpur yang kaya akan bakteri aerob.
c.          Metode treatment ponds/lagoons
Metode treatment ponds/lagoons atau kolam perlakuan merupakan metode yang murah namun prosesnya berlangsung relatif lambat. Pada metode ini, limbah cair ditempatkan dalam kolam-kolam terbuka.
3.      Pengolahan Tersier (Tertiary Treatment)
Pengolahan ini disesuaikan dengan kandungan zat yang tersisa dalam limbah cair/air limbah.
4.      Desinfeksi (Desinfection)
Desinfeksi atau pembunuhan kuman bertujuan untuk membunuh atau mengurangi mikroorganisme patogen (penyebab penyakit) yang ada dalam limbah cair/air limbah.
5.      Pengolahan Lumpur (Sludge Treatment)
Lumpur tersebut tidak dapat dibuang secara langsung, melainkan perlu diolah lebih lanjut. Endapan lumpur hasil pengolahan limbah biasanya akan diolah dengan cara diurai/ dicerna secara anaerob (anaerob digestion), kemudian disalurkan ke beberapa alternatif, yaitu dibuang ke laut atau ke lahan pembuangan(landfill), dijadikan pupuk kompos, atau dibakar (incinerated).